El departamento de publicaciones científicas se encarga de coordinar la elaboración de la Revista del Instituto Archivos de Neurociencias. Esta es una publicación trimestral, completamente digital, que presenta material científico producto de las investigaciones relacionadas con las neurociencias. De 1966 a 1980 apareció como Revista del Instituto Nacional de Neurología. De 1986 a 1995 apareció como Archivos del Instituto Nacional de Neurología y Neurocirugía. En 1996 inicia otra etapa con un pequeño cambio en el título y llamar a la revista "Archivos de Neurociencias México", como hasta ahora.
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